Neu in der 2005er-Version sind Reinigungstools wie »NoiseGate« für Störgeräusche in ruhigen Passagen oder eine Resampling-Automatik zum Ausgleich von Bandleiern. Mit dem integrierten »Music Editor« können einzelne Klicks und Störgeräusche durch direktes Zeichnen in der Wellen-Form entfernt werden. Ein Sample-genaues Zoom erleichtert dabei das Finden kritischer Stellen.

Mit der ebenfalls neuen Brennkontrolle lässt sich unmittelbar nach dem Schreiben der Erfolg des Brenn-Vorgangs prüfen. Das Music Cleaning Lab unterstützt jetzt zudem überlange CDs oder DVD, so dass bis zu 100 Stunden Musik auf einen Silberling passen.

Das Programm verfügt über funktional gute Filter und Effekte, die Knistern und Klicks nahezu optimal entfernen. Alle Effekte und Filter lassen sich in Echtzeit auf die geladenen Musikdateien anwenden, das heißt, es ist möglich, die gewählten Einstellungen so lange zu prüfen und zu verändern, bis man eine optimale Kombination der Filter gefunden hat.

Das Music Cleaning Lab orientiert sich an einer Audio-CD, so dass auch die Stapel-Verarbeitung von mehreren Tracks mit den gleichen Einstellungen möglich wird. Einzelne Titel werden in eine Projekt-Datei geladen und können "on-the-fly" auf CD geschrieben werden.